Program Magister akan ditempuh selama 2 tahun dengan fokus ke kemampuan dalam siswa dalam menentukan pemecahan masalah dan mendesain serta melakukan penelitian bioteknologi sesuai minat dan permasalahan yang ada. Siswa akan diberikan pengetahuan mendalam akan prinsip-prinsip bioteknologi, metodologi ilmiah untuk menganalisis secara komprehensif sistem biologi dan pengaplikasiaannya secara mendalam dalam bidang kesehatan, agro-biotechnology, industri dan lingkungan.